和目的其他非结瘤物种中始终是

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假发生或丢失的。这挑战了当前关于固氮植物微生物共生进化的观点。结瘤的进化通常被视为一个两步过程首先所有结瘤物种的祖先中发生未指定的易感事件使固氮进化枝中的物种达到结瘤的前体状态；随后结瘤同时发生发生八次根瘤菌发生两次。这个假设是最节俭的并且表明共生的独立得失数量最少。基于这一假设目前假设结瘤物种的非寄主近缘种通常处于结瘤的前体状态。在结瘤平行起源的假设下我们的结果很难解释。和的功能目前无法链接到任何非共生过程。
因此为什么这些共生基因在非结瘤植物物种中长期维持并随后独立丢失仍然不清楚。此外结瘤平行起源的假设意味着至少个基因的聚合募集以在和豆科植物中发挥共生功能。因为这个基因编码具有各种预测功能的蛋白质例如从细胞外信号受体到糖转运蛋白；数据集以及包含至少两种不同的发育表达模式结节器官发生和细胞内感染和或固定；图和数据集这意味着遗传复杂性状的平行进化。或者非结瘤植物中共生基因的平行丧失可以解释为结瘤的平行丧失。WhatsApp 数据库根据这一假设结瘤可能在固氮进化枝的祖先中只进化过一次。随后大多数后代谱系中的结瘤消失了。这种单一增益大量损失的假设在两个方面更适合我们的数据。首先单一增益解释了使用的至少个共


生基因的保守集的起源和苜蓿因为它们是同一祖先招募事件的结果。其次它更令人信服地解释了非结瘤植物中共生基因的平行丧失因为基因丧失与结瘤的丧失直接相关。此外单增益大量损失模型消除了易感事件这是目前无法通过实验解决的理论概念。因此我们赞成这种替代假设而不是目前最广泛持有的结瘤平行起源假设。结瘤损失没有争议因为通常认为豆科植物中至少发生过次。然而单一增益大量损失